La notifica di questi dati comporta un notevole dispendio di lavoro e, in alcuni casi, anche in termini di programmazione. Chi sostiene questi costi?
Per i concimi aziendali e ottenuti dal riciclaggio la registrazione è obbligatoria. Il Parlamento ha introdotto tale obbligo senza prevedere alcun indennizzo per gli interessati. Come per la maggior parte delle disposizioni di legge, i costi sono a carico degli interessati. Per i prodotti fitosanitari, i concimi minerali e i foraggi concentrati, la registrazione è invece facoltativa. Chi utilizza digiFLUX su base volontaria si fa carico dei rispettivi costi.